1949年9月，辽沈、淮海、平津三大战争 告捷，国民党残部撤往金马岛，第三野战军一部挥师江南，独立师红六团三营营长王本利和政委李山魁接到命令，预备跨海登陆作战，不料却折戟沉沙。李山魁牺牲，王本利为了纪念他更名“王山魁”。
“金门海战”的失利让新中国高层决心强大中国海军。抗美援朝胜利后，王山魁重返红海加入海军，并与医生许锦云结为夫妇。
王山魁潜心学习海军战法，后误打误撞打了一场漂亮海战而扬名，惟双料博士马建成对其嗤之以鼻。长波台建设过程中，苏方援助中途撤出，王山魁力荐马建成做总工，并意外得知马工竟然是妻子的初恋情人。
长波台试验接连失败，马建成当了逃兵。后王山魁和政委卢信泉力排众议，说服马建成回归。马建成冒死一试，长波台终于研制成功。
卢信泉无意中得知李山魁当年死里逃生，李请求卢保守秘密，并希望儿子李强将来效力海军。
十多年后，王山魁之子王海军想考大学，但王山魁却执意要儿子参军。协商未果，王山魁一怒把儿子送上补给舰当炊事员。马建成终于答应出任509所所长，但条件是送王海军去高考，遭王山魁拒绝。
马建成关于“信息化平台建设”的报告与“解决职工住房”的问题发生冲突，高傲的马建成赌气去了补给舰，巧遇王海军，并鼓励他要有远大的理想。
王海军要脱军装，父子间发生激烈的冲突。王山魁顿觉孤独，想起李山魁不禁伤感流泪。第一次看到父亲流泪的王海军决定留下。但他在一次部队的演习中出“阴招儿”，被罚禁闭四十天。
不料禁闭生活竟改变了王海军的一生，他的学习成绩突飞猛进。一向高傲的马建成终于放下了架子找卢政委解决了3000千万的经费问题。
李强考取海军舰艇学院，却被卢信泉之子卢向东顶替，卢亲自登门道歉，李山魁含笑而逝。王海军、李强、卢向东成为海军舰艇学院里有名的三剑客。
卢向东不顾父亲反对下海经商，王海军与李强毕业后分配至159舰。后王海军又到广州舰艇学院深造，毕业后去了最艰苦的南海扫雷舰做副长，与马建成之女马玉结婚。
此时，马建成已是肺癌晚期。信息化平台的模拟也进入要害阶段，强烈的使命感使马建成延续着生命的奇迹。
1990年，王海军和李强分任舰长和政委，为经过改装的国产159试航并实战检验159的各种性能。试航大获成功，听闻喜讯的马建成在岗位上溘然长逝。
卢向东回红海投资，仗义相助李美花，惊动警方。卢信泉了解事情始末后，父子间的隔阂终于消除。
1995年，戎马一生的王山魁离休。
新世纪海防更加重要，王海军和李强参加海军历史上最大规模的威慑性军事演习“长箭一号”。锅炉房起火，李强为救战友负重伤，王山魁此时方知李强身世。
马玉作为中国海洋权益方面的专家受邀在博敖亚洲论坛发表的讲演，受到热烈赞誉。王海军在理论和实战中成绩卓越，受到军委和海军总部的嘉奖。2007年奉命率舰队参加多国联合军事演习，以完美的表现赢得各参与国的尊重，胜利完成展示我海军实力和国家形象的任务。
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